安徽中醫(yī)藥大學(xué)創(chuàng)建于1959年，其前身為1952年創(chuàng)立的安徽省中醫(yī)進(jìn)修班（學(xué)校）。1959年，安徽省政府正式批準(zhǔn)成立安徽中醫(yī)學(xué)院，郭沫若先生題寫校名。1970年，安徽中醫(yī)學(xué)院并入安徽醫(yī)學(xué)院。1975年，國家教育部批準(zhǔn)恢復(fù)安徽中醫(yī)學(xué)院。2000年，安徽省醫(yī)藥學(xué)校并入安徽中醫(yī)學(xué)院。2011年，省政府批準(zhǔn)在安徽中醫(yī)學(xué)院的基礎(chǔ)上組建成立安徽省中醫(yī)藥科學(xué)院。2013年，教育部同意安徽中醫(yī)學(xué)院更名為安徽中醫(yī)藥大學(xué)。

學(xué)校是國家中醫(yī)臨床研究基地、國家中藥現(xiàn)代化科技產(chǎn)業(yè)（安徽）基地、國家中醫(yī)藥國際合作基地、國家藥品臨床研究基地、碩士研究生推薦免試單位。2005年以良好成績通過國家教育部本科教學(xué)工作水評估，2009年學(xué)校以優(yōu)異成績通過國家教育部中醫(yī)學(xué)專業(yè)試點(diǎn)認(rèn)證。

學(xué)校現(xiàn)占地總面積1171畝，有梅山路、史河路、少荃湖三個(gè)校區(qū)。東校區(qū)坐落于合肥市梅山路103號，西校區(qū)坐落于合肥市史河路45號，少荃湖校區(qū)坐落于前江路。教學(xué)科研儀器設(shè)備總值18907萬元。圖書館藏書200萬冊（其中紙質(zhì)圖書96.16萬冊），古籍部珍藏古籍線裝書3.3萬冊，是“全國古籍重點(diǎn)保護(hù)單位”。中藥標(biāo)本中心儲(chǔ)藏了11萬份藥用植物臘葉標(biāo)本，是全國醫(yī)藥院校珍藏標(biāo)本最豐富的標(biāo)本館。新安醫(yī)學(xué)文化中心是安徽省中醫(yī)藥文化宣傳教育基地。

學(xué)校現(xiàn)有全日制在校生14033人（其中博士生、碩士生1147人）。現(xiàn)有13個(gè)二級學(xué)院（部）、3所直屬附屬醫(yī)院、4所非直屬附屬醫(yī)院。現(xiàn)有教職工2500多人（含附院），其中副高以上職稱人員500余人。國醫(yī)大師1人，安徽省高校領(lǐng)軍人才5人，博士生導(dǎo)師22人，碩士生導(dǎo)師501人；享受國務(wù)院特殊津貼23人、省政府特殊津貼8人；安徽省學(xué)術(shù)與技術(shù)帶頭人、后備人才25人；國家名老中醫(yī)學(xué)術(shù)經(jīng)驗(yàn)項(xiàng)目指導(dǎo)老師26人。有來自國內(nèi)外的57名知名專家學(xué)者擔(dān)任我校客座教授。

學(xué)校現(xiàn)有23個(gè)本科專業(yè)（其中國家教育部高等學(xué)校專業(yè)5個(gè)，19個(gè)專業(yè)列入一本招生），有2個(gè)一級學(xué)科博士學(xué)位授予點(diǎn)，4個(gè)一級學(xué)科碩士學(xué)位授予點(diǎn)、25個(gè)二級學(xué)科碩士學(xué)位授予點(diǎn)、4個(gè)碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。有安徽省學(xué)科建設(shè)重大項(xiàng)目2個(gè)、國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科17個(gè)，省級B類重點(diǎn)學(xué)科11個(gè)。有7個(gè)衛(wèi)生部國家臨床重點(diǎn)專科，21個(gè)國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)建設(shè)專科、23個(gè)安徽省中醫(yī)藥重點(diǎn)專科。

學(xué)校以人才培養(yǎng)為第一要?jiǎng)?wù)，牢固確立教學(xué)中心地位，把提高教育教學(xué)質(zhì)量作為永恒主題，注重學(xué)生創(chuàng)新精神與能力素質(zhì)的培養(yǎng)，堅(jiān)持“弘揚(yáng)新安醫(yī)學(xué)，培育中醫(yī)人才”的辦學(xué)，人才培養(yǎng)質(zhì)量不斷提高。學(xué)校現(xiàn)有2個(gè)國家級教學(xué)團(tuán)隊(duì)、8個(gè)省級教學(xué)團(tuán)隊(duì)、1門國家級精品課程、1門國家級精品資源共享課程、35門省級精品課程、2個(gè)國家級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心、1個(gè)國家級專業(yè)綜合改革試點(diǎn)項(xiàng)目、2個(gè)國家級卓越醫(yī)生（中醫(yī)）教育培養(yǎng)計(jì)劃。5年來，先后獲國家級、省級質(zhì)量工程項(xiàng)目200余項(xiàng)，國家級教學(xué)成果二等獎(jiǎng)1項(xiàng)、省級教學(xué)成果特等獎(jiǎng)3項(xiàng)、一等獎(jiǎng)10項(xiàng)。

學(xué)校注重辦學(xué)的彰顯，深入推進(jìn)教學(xué)改革，舉辦新安醫(yī)學(xué)教改實(shí)驗(yàn)班，建立臨床客觀結(jié)構(gòu)化考試中心。設(shè)立大學(xué)生課外科技創(chuàng)新與創(chuàng)業(yè)基金；開展“百人獲獎(jiǎng)、千人參與、萬人受益”的大學(xué)生知識(shí)技能競賽和“挑戰(zhàn)杯”等各級各類競賽活動(dòng)；廣泛開展各類社會(huì)實(shí)踐活動(dòng)。2010?學(xué)校共有學(xué)生200余人次在學(xué)術(shù)科技與創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)領(lǐng)域獲省部級以上表彰和獎(jiǎng)勵(lì)80余項(xiàng)。學(xué)校曾被授予全國大中學(xué)生志愿者“三下鄉(xiāng)”社會(huì)實(shí)踐活動(dòng)先進(jìn)集體。2010年以來，學(xué)校畢業(yè)生均就業(yè)率在94%以上，連續(xù)獲得安徽省普通高校就業(yè)工作“先進(jìn)集體”或“標(biāo)兵單位”稱號。

學(xué)校大力推進(jìn)科技強(qiáng)校戰(zhàn)略，積極促進(jìn)教學(xué)水與人才培養(yǎng)質(zhì)量的提高。5年來，學(xué)校共承擔(dān)各級各類項(xiàng)目1100余項(xiàng)，“十二五”國家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目“新安醫(yī)學(xué)傳承與發(fā)展研究”順利通過國家科技部驗(yàn)收，為提升我校科研軟實(shí)力打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)，以國家社會(huì)科學(xué)基金項(xiàng)目為代表的人文社會(huì)研究項(xiàng)目取得新的突破，進(jìn)一步提升了我校的科學(xué)研究水。獲得國家級科研項(xiàng)目200余項(xiàng)，科研經(jīng)費(fèi)2億余元。取得研究成果300余項(xiàng)，獲得省部級以上科技獎(jiǎng)勵(lì)37項(xiàng)（其中國家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)1項(xiàng),中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)科技獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)1項(xiàng)）。現(xiàn)有10個(gè)省級科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，28個(gè)省級以上重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及工程（技術(shù)）研究中心。建立了安徽省中藥材科技產(chǎn)業(yè)戰(zhàn)略聯(lián)盟。學(xué)校被國家科學(xué)技術(shù)部授予“全國科技特派員工作先進(jìn)集體”稱號，被國家中醫(yī)藥管理局授予“中醫(yī)藥科技管理工作先進(jìn)集體”稱號。學(xué)校獲中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)“推動(dòng)中醫(yī)藥學(xué)術(shù)發(fā)展特別貢獻(xiàn)獎(jiǎng)”。

學(xué)校不斷加強(qiáng)產(chǎn)學(xué)研用合作，服務(wù)地方經(jīng)濟(jì)社會(huì)建設(shè)能力不斷增強(qiáng)。學(xué)校與黃山、亳州、六安、桐城、廬江、績溪、舒城等10余個(gè)市縣人民政府簽訂全面合作協(xié)議，與河南宛西、江蘇康緣、深圳三九、億帆鑫富、海南海力藥業(yè)等國內(nèi)知名中醫(yī)藥企業(yè)簽訂戰(zhàn)略合作協(xié)議，建有亳州濟(jì)人藥業(yè)等30余個(gè)產(chǎn)學(xué)研合作基地，服務(wù)地方經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展的能力不斷提升。積極為政府在出臺(tái)有關(guān)中醫(yī)藥發(fā)展規(guī)劃和相關(guān)政策提供決策咨詢，學(xué)校在國家中藥現(xiàn)代化科技產(chǎn)業(yè)（安徽）基地建設(shè)中做出了積極貢獻(xiàn)。第一附屬醫(yī)院是全省最大的三級甲等綜合性中醫(yī)醫(yī)院；第二附屬醫(yī)院是全國首家也是規(guī)模最大的三級甲等針灸專科醫(yī)院；第三附屬醫(yī)院是國家第三批重點(diǎn)建設(shè)的中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院，神經(jīng)病學(xué)研究所附屬醫(yī)院是一所國內(nèi)外有影響的以“肝豆?fàn)詈俗冃栽\治”為優(yōu)勢的專科醫(yī)院，國醫(yī)堂是一所為廣大患者以純中醫(yī)方式為主要醫(yī)療手段的醫(yī)療單位，其都成為開展社會(huì)服務(wù)的重要力量。

學(xué)校與美國、澳大利亞等19個(gè)國家和地區(qū)的50個(gè)醫(yī)療和教育機(jī)構(gòu)建立了友好合作關(guān)系。1994年獲準(zhǔn)招收國外留學(xué)生，先后有20多個(gè)國家和地區(qū)的學(xué)員來校攻讀碩士、學(xué)士學(xué)位以及臨床研修。與美國、瑞典、新加坡、日本、韓國及港澳臺(tái)地區(qū)的院校開展學(xué)者互訪和學(xué)生交流活動(dòng)。

在58年的辦學(xué)歷程中，學(xué)校逐漸形成了以“至精至誠、惟是惟新”為校訓(xùn)的優(yōu)良傳統(tǒng)。目前，學(xué)校已發(fā)展成一所以中醫(yī)藥學(xué)科為主，相關(guān)學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展，辦學(xué)層次齊全，中醫(yī)藥鮮明的高等中醫(yī)藥院校。

面向未來，學(xué)校將進(jìn)一步堅(jiān)定中醫(yī)信念，弘揚(yáng)中醫(yī)精神，秉承“至精至誠、惟是惟新”的理念，實(shí)施“質(zhì)量立校、人才興校、科技強(qiáng)校、弘校、文化塑校、和諧融校”的辦學(xué)方略，圍繞，強(qiáng)化優(yōu)勢，提升質(zhì)量，著力培育“精誠是新”中醫(yī)藥人才，構(gòu)筑安徽中醫(yī)藥協(xié)同創(chuàng)新高地，弘揚(yáng)“北華佗南新安”中醫(yī)藥文化，引領(lǐng)安徽中醫(yī)藥事業(yè)產(chǎn)業(yè)發(fā)展，建成富有、卓有貢獻(xiàn)、高水有影響的安徽中醫(yī)藥大學(xué)，為建設(shè)美好安徽、服務(wù)人民大眾健康做出更大貢獻(xiàn)。