福建醫科大學現在有2個校區，分別為福建醫科大學上街、臺江校區。

福建醫科大學創建于1937年，前身是福建省立醫學專科學校，2003年，福建省人民政府確定我校為省屬重點建設高校。學校先后被評為“全國教育系統抗震救災先進集體”、福建省黨建和政治工作先進高校、省文明學校、省計劃生育先進單位、省衛生先進單位、省綠化模范單位和省級花園式單位等。學校現有上街、臺江2個校區，占地約1500畝，校舍建筑面積40多萬方米。

1、福建醫科大學上街校區

地址：福州市閩侯縣上街鎮學園路1號

2、福建醫科大學臺江校區

地址：福州市交通路88號

學校擁有上街、臺江2個校區，占地約1500畝，校舍建筑面積42萬多方米，辦學主體位于福州市大學新區上街校區。設有20個學院(部)，學生21000多人、教職醫護員工10700多人(含附屬醫院)，其中校本部1200多人。建有5所直屬附屬醫院，其中附屬第三醫院正在建設中。堅持開放辦學理念，先后與海內外30多所高校和科研院所開展了多層次、多角度的合作。