學院占地1028畝，建筑面積19.75萬方米，分為兩個校區。老校區位于濟南市歷城區遙墻鎮，占地420畝，建筑面積5.05萬方米，建有教學樓2棟，辦公樓1棟，學生公寓樓3棟，大小學生職工餐山東杏林科技職業學院廳3個，風雨運動場面積10000方米，圖書館、閱覽室各1個，設有超市、儲蓄所、郵局、衛生室、洗衣房、理發室、開水房、鍋爐房（冬季供暖）等，生活設施一應俱全。

新校區位于濟南市東部大學城，依山傍泉，占地608畝，總建筑面積14.7萬方米，包括能容納萬名學生同時上課的教學樓1棟（30000方米），多功能綜合實驗樓1棟，圖書館1座，高檔學生公寓5棟，學生餐廳1棟，風雨運動場60000方米。另有二期工程6棟學生公寓、一棟現代化綜合圖書樓約50000方米，正在建設中，2006年9月正式投入使用。

為滿足各專業實驗實訓教學的需要，學院加大基礎教學設施投入，現有各類教學儀器設備總價值為3000萬元，其中適用于醫學類專業教學儀器設備總值1600萬元，同時還建有多功能的現代化實驗中心，擁有各類專業實驗室56個，品牌計算機1000臺，數字語音設備598座，解剖標本室、解剖模型室、解剖多媒體主控室、顯微鏡實驗室、化學實驗室、生物化學實驗室、機能實驗室、病理室、臨床診斷實驗室、手術室、婦產科實驗室、口腔實驗室、口腔技工實驗室、護理實驗室、護理示教室、針灸推拿按摩實驗室、中藥實驗室等30個醫學實驗室，能充分滿足各學科各專業的實驗實訓教學需要。各專業實驗課開出率均達到90％以上，醫學類實驗課開出率達98％。學院目前藏書41萬冊，學生運動場地6萬方米。

學院現有章丘市中醫院、淄博市第八人民醫院兩所附屬醫院，另有濟南市、章丘市等3所非直屬附屬醫院，另與全省20多所二級甲等以上綜合醫院簽訂教學與實協議，并與50多家大中型企業簽訂實訓、實就業基地協議，為學生技能培訓和實踐操作能力的提高提供了有力的保障。