日,第十七屆國際遺傳工程機器大賽(International Genetically Engineered Machine Competition,iGEM)決賽于線上舉行。由中國海洋大學8名本科生組成的iGEM團隊OUC-R獲得金獎,這是中國海大學子連續第6年獲此殊榮。
2021年IGEM團隊OUC-R由食品科學與工程學院2018級食品科學與工程專業本科生呂博文、2020級食品科學與工程專業本科生房珈鋮,醫藥學院2019級藥學專業本科生傅水萍、高慧姝,水產學院2018級海洋漁業科學與技術專業本科生薄海天,海洋生命學院2019級生物科學專業本科生林錦,信息科學與工程學部2018級計算機科學與技術專業本科生丁澤中、2019級計算機慧與卓越工程師班本科生楊沛霖組成。團隊以食品科學與工程學院核酸化學與生物技術實驗室為依托,在食品科學與工程學院梁興國教授的指導下采取自我組織、自主管理,在梁教授指導下進行選題,充分發揮每個同學的特長優勢,實現了多學科交叉融合。
OUC-R參賽項目是“A gene exPssion regulator achieved by conformation changes of DNA secondary structure”,團隊成員利用一種帶發夾的DNA雙環結構,通過誘導物改變序列的螺旋方向。ZBP1或者抗體等誘導物與結構中的嘌呤-嘧啶交替排列的序列(APP序列)相互作用,使APP序列從右螺旋變為左螺旋,其連接數LK值從+1變為-1,而為保證體系的LK值為6,發夾上的啟動子序列會變為右螺旋,其LK值會從0變為+2,此時錘頭式Ribozyme基因就能正常表達。隨著轉錄泡的形成,APP序列又會變為+1,通過檢測錘頭式Ribozyme的濃度大小,可以推測出待檢測物質的濃度及其與APP序列的結合能力。同時,團隊成員提高了反應條件中的鎂離子濃度,使得誘導物未添加前就存在Z-DNA,然后進行進一步研究。為了進行對照,團隊成員還將APP序列替換成隨機序列,進行同樣的實驗,并且測試了不同溫度下雙環結構的形成情況。本項目可用于Z-DNA特異性結合物質的檢測、鑒定,以及為阿爾茨海默病與乳腺癌等疾病提供了新的治療思路。
國際遺傳工程機器大賽(iGEM)由麻省理工學院于2003年創辦,是合成生物學領域的頂級國際性學術競賽,旨在利用標準生物模塊構建基因回路、建立有效的數學模型,以實現對復雜的人工生物系統進行預測、操縱和測量。據了解,今年共有來自世界各地352支隊伍、超3000人參與這項賽事。
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