上海交通大學醫學院位于創新求索、文化薈萃、包容并蓄的黃浦腹地，紅墻映日、梧桐環繞。其前身是由圣約翰大學醫學院(1896-1952)、震旦大學醫學院(1911-1952)、同德醫學院（1918-1952)于1952年全國高等學校院系調整時合并而成的上海第二醫學院，1985年更名為上海第二醫科大學。1997年學校通過了“211工程”立項。2005年7月，上海交通大學與上海第二醫科大學合并，成立了新的由教育部、上海市政府重點共建的上海交通大學醫學院，進入“985”高校行列。2010年11月，學院成為衛生部與教育部合作共建的第一批十個重點高校中的一員。

歷經百余年的春華秋實和六十載的風雨征程，醫學院秉持“團結、勤奮、求實、進取”的院訓及“博極醫源、精勤不倦”的學院精神，始終以謀國家之強盛、求科學之真知、踐醫學之神圣為己任，與時代同呼吸、與社會共命運，在醫療衛生事業的壯美畫卷中留下了諸多濃墨重彩的筆觸，為社會輸送了7萬余名醫學人才。學院現已發展成為一所享有較高國際聲譽，師資力量雄厚，優勢明顯，學術成績卓著，集醫、教、研以及社會服務全面發展的研究型、創新型院校。

醫學院堅決貫徹“人才強院”的主戰略，切實加強高層次人才隊伍建設，大師云集、人才薈萃。學院現有教職醫務員工25255名，專任教師640名，在職高級職稱2632人，博士生導師669人，碩士生導師1173人。其中包括中國科學院院士2人，中國工程院院士13人，歐洲科學院外籍院士2人，美國科學院外籍院士1人，法國科學院外籍院士2人，美國醫學科學院外籍院士2人，英國皇家內科醫師學院院士1人，法國國家醫學科學院院士2人，發展中國家科學院院士2人，國際牙醫學院院士1人，中央“*”9人，中央“青年*”15人，國家“973”項目首席科學家17人次，教育部“*特聘教授/講座教授”25人，國家杰出青年基金獲得者28人。

醫學院持續推動教育教學改革，不斷加強以基地建設與臨床優勢為依托，以轉化醫學理念為內涵的“卓越醫學教育體系”建設。

醫學院包含23個學院（系），13所附屬醫院。覆蓋生物學、基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學等8個一級學科博士學位授權點、4個一級學科博士后流動站。有臨床醫學八年制（授予博士學位）、臨床醫學八年制（口腔醫學方向，授予博士學位）和7個本科專業（臨床醫學、口腔醫學、生物醫學科學、預防醫學、醫學檢驗學、護理學、營養學）。其中，臨床醫學、口腔醫學、醫學檢驗學、護理學為國家專業；臨床醫學八年制（法文班）、臨床醫學八年制（4+4碩博班）、臨床醫學五年制（兒科學方向）、臨床醫學五年制（英語班）是學院的班級。目前學院有在校生7486名，其中本科及長學制學生2655名，研究生4566名，留學生265名。