上海海洋大學現在有3個校區，分別為：浦東新區滬城環路校區、楊浦區軍工路校區和楊浦區民星路校區

上海海洋大學前身是建于1912年的江蘇省立水產學校，1952年成為國內第一所本科水產高校??上海水產學院，1985年更名為上海水產大學。學校目前有浦東新區滬城環路校區、楊浦區軍工路校區、楊浦區民星路校區3個校區，根據上海高校布局結構調整規劃，2008年整體搬遷至上海臨港新城辦學，主校區滬城環路校區占地約1600余畝，規劃建設面積58.6萬方米。

1.上海海洋大學浦東新區滬城環路校區

地址：上海海洋大學浦東新區滬城環路校區。上海海洋大學是上海市人民政府與國家海洋局、農業部共建的多科性應用研究型高等學府，前身是張謇、黃炎培創建于1912年的江蘇省立水產學校，1952年升格為中國第一所本科水產高校??上海水產學院，1985年更名為上海水產大學，2008年更為現名。1914年9月1日定校訓：勤樸忠實。

2.上海海洋大學楊浦區軍工路校區

地址：楊浦區軍工路334號。學校目前有上海市浦東新區滬城環路校區、楊浦區軍工路校區、楊浦區民星路校區3個校區。其中，主校區滬城環路校區占地約1600余畝，規劃建設面積58.6萬方米。

3.上海海洋大學楊浦區民星路校區

地址：軍工路334號。學校教育體系完備，優勢學科明顯，研究成果顯著。擁有研究生教育、普通本專科教育、繼續教育及留學生教育。擁有2個博士后科研流動站、3個一級學科博士學位授權點、10個一級學科碩士學位授權點、4個研究生專業學位授權點、47個本科專業及方向、10個高職專業。