對于女職工在孕期休長病的情況，根據(jù)上海市的有關(guān)文件，主要有以下處理原則：

1、職工應(yīng)履行請病假手續(xù)，提供符合法律要求的病假單。一般由醫(yī)療單位開具病假條(通常為2周/次)，并由職工提交給企業(yè)。經(jīng)企業(yè)審核通過后，職工開始休病假。

2、在長病假前六個月內(nèi)，企業(yè)支付病假工資，具體標(biāo)準(zhǔn)如下：

連續(xù)工齡不滿2年的，按本人工資的60%計發(fā);

連續(xù)工齡滿2年不滿4年的，按本人工資的70%計發(fā);

連續(xù)工齡滿4年不滿6年的，按本人工資的80%計發(fā);

連續(xù)工齡滿6年不滿8年的，按本人工資的90%計發(fā);連續(xù)工齡滿8年及以上的，按本人工資的100%計發(fā)。

本人工資按“職工正常情況下實得工資的70%計算。”

說明1：總體上是在原有實得工資的基礎(chǔ)上“折上加折”。

說明2：“職工正常情況下實得工資”是包含在職在崗期間的獎金、津貼、補貼等。因休病假的職工未能正常參加工作，因此前述因生產(chǎn)工作而產(chǎn)生的工資性收入是無法享受的，典型的示例如高溫補貼。

3、在長病假六個月期滿后，企業(yè)支付疾病救濟費，具體標(biāo)準(zhǔn)如下：

職工疾病或非因工負(fù)傷連續(xù)休假超過6個月的，由企業(yè)支付疾病救濟費，其中連續(xù)工齡不滿1年的，按本人工資的40%計發(fā);連續(xù)工齡滿1年不滿3年的，按本人工資的50%計發(fā);連續(xù)工齡滿3年及以上的，按本人工資的60%計發(fā)。

4、病假待遇低的“兩個保底”和病假待遇高的“一個封頂”，具體標(biāo)準(zhǔn)如下：

第一個保底：職工疾病或非因工負(fù)傷休假待遇低于本企業(yè)月均工資40%的，應(yīng)補足到本企業(yè)月均工資的40%。

第二個保底：職工疾病休假工資或疾病救濟費不得低于當(dāng)年本市企業(yè)職工最低標(biāo)準(zhǔn)的80%。企業(yè)職工疾病休假工資或疾病救濟費最低標(biāo)準(zhǔn)不包括應(yīng)由職工個人繳納的養(yǎng)老、醫(yī)療、失業(yè)保險費和住房公積金。

以上是上海市關(guān)于懷孕女職工請病假，在病假期間的工資發(fā)放標(biāo)準(zhǔn)。

拓展閱讀：懷孕女工合同期滿怎么辦

一、懷孕女工合同期滿怎么辦

勞動法在關(guān)于解除勞動合同的規(guī)定中，對“三期”(孕期、產(chǎn)期、哺乳期)內(nèi)的女職工給予了特殊保護，即對三期內(nèi)的女工，企業(yè)不得在女工無主觀過錯的情況下，與其解除勞動合同。但在勞動合同終止的規(guī)定中，只是籠統(tǒng)的規(guī)定了，勞動合同期滿，勞動合同即行終止。但是勞動部門在關(guān)于貫徹勞動法若干問題意見中，從女職工的生育及哺乳期等實際情況出發(fā)，又做了補充規(guī)定：“勞動者在孕期、產(chǎn)期、哺乳期內(nèi)，勞動合同期限屆滿時，用人單位不得終止勞動合同，合同期限應(yīng)自動延續(xù)至相應(yīng)的期限屆滿為止。

二、懷孕女工有哪些權(quán)利

我國的勞動法，勞動合同法，婦女權(quán)益保障法，女職工勞動保護條例等法律法規(guī)，以及許多地方的地方性法規(guī)都對保護懷孕婦女職工作了規(guī)定，賦予了懷孕女職工的法律權(quán)利，概括起來說，懷孕女職工有以下的法律權(quán)利：

第一，懷孕女職工有不被解聘的法律權(quán)利。《中華人民共和國婦女權(quán)益保障法》明確規(guī)定：任何單位不得以結(jié)婚、懷孕、產(chǎn)假、哺乳等為由，辭退女職工或單方解除勞動合同。《勞動法》第29條規(guī)定：女職工在孕期、產(chǎn)期、哺乳期內(nèi)的，用人單位不得解除勞動合同。

第二，懷孕女職工有要求調(diào)換適合孕婦工作的權(quán)利。在我國，幾乎所有的工作領(lǐng)域都有婦女的身影，婦女懷孕后，有些崗位就不再適應(yīng)，例如實行“三班倒”的工作， 懷孕的婦女在后期，就不適合繼續(xù)實行“三班倒”的工作時間模式;從事活動強度比較大的或者重體力勞動的工作，就需要調(diào)整相對比較輕松，活動強度不大的工作崗位;對從事有可能影響胎兒發(fā)育的直接接觸油漆、化工等工作崗位的，更要給以調(diào)換，各用人單位要在力所能及的情況下給孕婦職工調(diào)換工作，以適合孕婦的生理 要求。

第三，懷孕女職工有在工作時間孕期保健和產(chǎn)前檢查的權(quán)利。對懷孕女職工的產(chǎn)前檢查(包括妊娠十二周內(nèi)的初查)，用人單位要提供方便，在勞動時間進行產(chǎn)前檢查的，按出勤對待，不能按病假、事假、礦工處理;有定額考核的工種應(yīng)扣除相應(yīng)的勞動定額。

第四，懷孕婦女的休息權(quán)。對懷孕7個月以上(含7個月)的女職工不得安排從事夜班和加班勞動，每天給予工間休息1小時，算作勞動時間。懷孕的婦女由于種種原因而終止妊娠，享有終止妊娠后的休息權(quán)。女職工懷孕流產(chǎn)的，應(yīng)當(dāng)根據(jù)醫(yī)務(wù)部門的證明，給予一定時間的產(chǎn)假。女職工懷孕不滿4個月流產(chǎn)時，給予15～30天 的產(chǎn)假;懷孕滿4個月以上流產(chǎn)者，給予42天產(chǎn)假。產(chǎn)假期間工資照發(fā)。

根據(jù)法律當(dāng)中對女職工三期的保護，要是女職工在懷孕期間勞動合同剛好到期的話，那么單位是不能在其無主觀過錯的情況下，解除與其的勞動合同的。