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設有臨床醫學、臨床醫學（生殖醫學）、臨床醫學（婦幼衛生）、預防醫學（營養與食品衛生）、應用心理學（醫學心理學）、生物醫學工程、市場營銷（醫藥營銷）公共事業管理（衛生事業管理）、藥學、藥學（臨床藥學）藥物制劑、醫學檢驗、醫學檢驗（臨床輸血）醫學影像學、護理學、護理學（英語護理）等１６個本科專業及專業方向，以及臨床醫學、醫學營養、藥學、醫學檢驗技術、醫學影像技術、醫學生物技術、護理學、口腔醫學等８個專科專業，涵蓋醫學、理學、管理學等學科門類。

學校堅持以教學內容改革為重點，以學科建設為基礎，以師資培養為關鍵，以提高人才培訓質量，堅持立足基層，辦出的辦學指導，大力加強學科建設和課程建設。現有吉林拾十一五”重點學科２個，部級醫學專業重點實驗室２個，省重點扶持專科１個，國家高等學校專業建設點１個，省高等學校專業建設點２個。５年，獲得國家精品課程１門，省級精品課程５門，省級優秀課程１３門；統編教材３６部，主編“十五”、“十一五”國家級規劃教材９部，１部獲得全國教材評比一等獎。

積極發展研究生教育。學校１９９６年即開始與白求恩醫科大學聯合培養碩士研究生，１９９９年納入解放軍第四軍醫大學研究生招生計劃，授權二級學科１２個，３２人被分別受聘為碩士、博士研究生導師。５年，與吉林大學、第四軍醫大學、延邊大學、吉林師范大學等聯合培養研究生２０多名。

科學研究成績顯著。先后完成國家、軍隊重點課題８６項，獲國家、軍隊級科技進步獎和科技成果獎５８３項，國家發明獎和國家專利３９項，各級教學成果獎和教育技術成果獎４０余項。在省級以上學術刊物和會議發表論文６０００余篇。５年，承擔省級科研項目９４項；省級以上學術刊物發表論文１２１８篇，SCI、EI、TSTP收錄３５篇；主編出版學術專著１０部。現有省級科研實驗室３個，中央與地方共建優勢學科實驗室