第十二條為貫徹“以人為本”的教育理念，學校給予部分優秀本科學生轉專業機會，新生入學后可依照當年執行的《長春中醫藥大學本科優秀學生轉專業管理辦法》進行申請。

學校現有國家級專業建設點4個，國家級專業綜合改革試點專業1個，省級品牌專業建設點6個，省級專業8個。有國家級精品資源共享課2門，國家級精品課程3門，國家級人才培養模式創新實驗區1個，主編國家級“十二五”規劃教材4部，主編國家級“十二五”行業規劃教材45部。入選國家級大學生文化素質教育基地，國家級中醫藥文化宣傳教育基地。
學校有較強的科研實力，建立了較完備的中醫藥科學研究體系，現有52個國家級和省部級科研臺，“十二五”期間，承擔了國家973項目、國家重大藥物創制、國家自然科學基金項目等重大重點科技項目84項，取得了163項高水的科研成果，有47項科技成果實現了轉化，走出了學研產相結合，服務地方經濟社會發展的辦學之路。
學校不斷拓展國際化辦學視野，是教育部首批批準接收和培養外國留學生及臺港澳地區學生和中國政府獎學金來華留學生接收院校，與21個國家和地區的高校、研究單位保持著長期的友好往來，開展廣泛的學術交流與合作。
多年來，學校建設發展得到社會各界的廣泛贊譽和各級政府的充分肯定，榮獲“全國文明單位”稱號，被教育部授予“全國畢業生就業典型經驗高校”。基礎醫學院榮獲“全國教育系統先進集體”稱號；附屬醫院榮獲“全國五一勞動獎狀”、“全國衛生系統先進集體”、“全國援外醫療工作先進集體”等稱號。