吉林醫(yī)藥學(xué)院：學(xué)生應(yīng)當(dāng)在學(xué)院完成學(xué)業(yè)，原則上不得轉(zhuǎn)專業(yè)。只有專長(zhǎng)生和特殊生及需求生才可以申請(qǐng)并經(jīng)批準(zhǔn)后轉(zhuǎn)專業(yè)。

基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院成立于1993年11月，前身為空軍醫(yī)學(xué)高等專科學(xué)校基礎(chǔ)部，編制16個(gè)教研室（中心），教職人員204人。1999年7月，轉(zhuǎn)隸為第四軍醫(yī)大學(xué)吉林軍醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)部，2004年8月吉林軍醫(yī)學(xué)院整體移交吉林省獨(dú)立辦學(xué)，基礎(chǔ)部隨之更名為吉林醫(yī)藥學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院。
現(xiàn)有外語(yǔ)、組織學(xué)與胚胎學(xué)、人體解剖學(xué)、生理學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)、病理學(xué)與病理生理學(xué)、藥理學(xué)7個(gè)教研室；基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)中心1個(gè)，下設(shè)形態(tài)實(shí)驗(yàn)室、機(jī)能實(shí)驗(yàn)室、生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室，承擔(dān)學(xué)校的大學(xué)英語(yǔ)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)課程的教學(xué)和實(shí)驗(yàn)任務(wù)。基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院現(xiàn)有教職員工108人，其中教授16人，副教授28人；博士12人，碩士64人。

隸屬軍隊(duì)期間，全體教師在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)的教學(xué)科研工作中，積極探索，勇于創(chuàng)新，共發(fā)表學(xué)術(shù)論文3千余篇，編撰并出版專著、教材50余部，有78項(xiàng)成果獲軍隊(duì)科技進(jìn)步獎(jiǎng)。分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室、生理機(jī)能實(shí)驗(yàn)室為軍隊(duì)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室.先后有4人被評(píng)為“全軍優(yōu)秀教員”，1人被空軍評(píng)為“先進(jìn)工作者”，4人獲得總后勤部“育才獎(jiǎng)”銀獎(jiǎng)，42人在教學(xué)科研工作中榮立三等功。
2004年從部隊(duì)移交到地方辦學(xué)后，基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院全體教師積極調(diào)整辦學(xué)思路，轉(zhuǎn)變教育理念，順利完成了以軍事醫(yī)學(xué)為教學(xué)重點(diǎn)向普通醫(yī)學(xué)高等教育為重點(diǎn)的轉(zhuǎn)變，在較短的時(shí)間內(nèi)取得了多項(xiàng)成果。1人被評(píng)為吉林市勞動(dòng)模范,1人被評(píng)為吉林省巾幗建功模范，1人被評(píng)為吉林省教育系統(tǒng)師德先進(jìn)個(gè)人。以竇肇華教授為負(fù)責(zé)人的《組織學(xué)與胚胎學(xué)》專科課程被評(píng)為國(guó)家精品課程，潘文干教授主編的衛(wèi)生部醫(yī)學(xué)專科規(guī)劃教材《生物化學(xué)》（第五版）獲2005年“全國(guó)高等學(xué)校醫(yī)藥優(yōu)秀教材”一等獎(jiǎng)，以竇肇華教授為負(fù)責(zé)人的臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)（生殖醫(yī)學(xué)方向）為國(guó)家規(guī)劃建設(shè)的第一類專業(yè)建設(shè)點(diǎn)，人體解剖和組織胚胎學(xué)被確定為吉林省“十二五”重點(diǎn)學(xué)科；組織學(xué)與胚胎學(xué)教研室被評(píng)為省優(yōu)秀教學(xué)團(tuán)隊(duì)；獲得省教學(xué)成果二等獎(jiǎng)1項(xiàng)，三等獎(jiǎng)1項(xiàng)，省級(jí)教學(xué)技術(shù)成果二等獎(jiǎng)1項(xiàng)，三等獎(jiǎng)2項(xiàng)，省級(jí)科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)1項(xiàng)，吉林市科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)1項(xiàng)；中藥抗微波輻射研究實(shí)驗(yàn)室為吉林省中醫(yī)藥管理局二級(jí)科研實(shí)驗(yàn)室，輻射損傷防治實(shí)驗(yàn)室被確定為吉林省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和吉林省衛(wèi)生廳重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室為吉林省中醫(yī)藥管理局二級(jí)科研實(shí)驗(yàn)室。現(xiàn)有國(guó)家級(jí)精品課程1門，省級(jí)精品課程6門，省級(jí)優(yōu)秀課程6門；承擔(dān)國(guó)家、省、市及學(xué)院立項(xiàng)的教學(xué)、科研課題40余項(xiàng)，出版衛(wèi)生部規(guī)劃教材10部，出版其他教材22部。